Количество мутаций вируса составляет примерно 24 мутации в год.
Количество мутаций в каждом гаплотипе – это мера расстояния от общего предка, от вершины пирамиды, до нас, современников.
Эволюция случайно генерирует огромное
количество мутаций: у кого-то длинный хвост, у кого-то длинные уши, у кого-то перепонки, у кого-то панцирь другой формы.
Кроме того,
количество мутаций de novo увеличивается с возрастом.
К 2005 году у вируса сезонного гриппа вновь накопилось энное
количество мутаций.
Привет! Меня зовут Лампобот, я компьютерная программа, которая помогает делать
Карту слов. Я отлично
умею считать, но пока плохо понимаю, как устроен ваш мир. Помоги мне разобраться!
Спасибо! Я стал чуточку лучше понимать мир эмоций.
Вопрос: жиловатый — это что-то нейтральное, положительное или отрицательное?
При наличии достаточного количества времени – или, скорее, достаточного
количества мутаций – дупликация и перетасовка генов может приводить к появлению новых генов, значительно отличающихся от предковых.
Таким образом, у детей немолодого отца
количество мутаций больше, чем у детей молодого отца.
Мы способны выдержать огромное
количество мутаций без всякого вреда для себя.
Используя эту константу скорости мутаций можно рассчитывать, сколько времени потребуется для прохождения определённого
количества мутаций во фрагменте Y-хромосомы определённого размера.
Во-первых, не совсем очевидно, что изложенный метод даёт минимально возможное
количество мутаций, необходимые для построения дерева.
Однако рано или поздно
количество мутаций будет настолько большим, что эти процессы уже не смогут оберегать вид от гибели.
Чтобы найти наиболее экономное дерево для этих таксонов, нужно было бы рассмотреть все 15 возможных топологий некорневых деревьев с 5 таксонами и вычислить минимальное
количество мутаций для каждой.
В примере, когда поместили и на концы ветвей одинаковой длины, предположили, что
количество мутаций, которые каждый из них претерпел от своего общего предка, было одинаковым.
При работе с реальными данными последовательности, конечно, нужно подсчитать
количество мутаций, необходимых для дерева, среди всех сайтов в последовательностях.
Если под вершиной находятся два разных основания (или множества оснований, которые не пересекаются), нужно будет увеличить
количество мутаций на 1 и объединить два основания (или взять объединение множеств) в один больший набор возможных оснований на более высокой вершине.
Это означает, что не получится определить точную длину ребра, используя
количество мутаций, происходящих при переходе вдоль него.
Таким образом, молекулярные часы означают, что
количество мутаций на любом ребре пропорционально прошедшему времени, при этом константа пропорциональности представляет собой постоянную скорость мутации.
Метод UPGMA всегда размещает все таксоны на одинаковом расстоянии от корня, так что
количество мутаций от корня до любого таксона одинаково.
Можно исключить некоторые варианты из перебора при использовании метода экономии, если заметим, что не все сайты будут влиять на
количество мутаций, необходимых для дерева.
Как увидите в упражнениях, могут существовать такие разметки оснований на внутренних вершинах, которые не согласуются с разметками, производимыми данным методом, но при этом достигается то же самое минимальное
количество мутаций.
Таким образом, вертикальные рёбра на правом дереве считываются как не вносящие никакого вклада в
количество мутаций; они служат исключительно для разделения различных линий для повышения читабельности.
Если предположить, что существуют молекулярные часы, то независимо от того, рисуем ли длины рёбер, представляющие
количество мутаций или только прошедшее время, то нарисуем одну и ту же фигуру с точностью до масштаба этой константы.
Согласно исследованию, пары таких близнецов имеют геномы, различающиеся в среднем на 5,2 мутации, которые происходят на ранних стадиях развития, а 15 % однояйцевых близнецов имеют значительное
количество мутаций, специфичных для одного из них.
Все доказательства, которыми располагает земная наука, – некоторый рост
количества мутаций, наблюдаемый за последние сто-двести лет…
Вместо этого метод подразумевает неявное предположение о том, что мутации случаются редко, а лучшее объяснение истории эволюции – это то, которое требует наименьшего
количества мутаций.
У каждого таксона было одинаковое количество времени, чтобы эволюционировать от корневого предка, поэтому каждый таксон накопит одинаковое
количество мутаций.
Давайте на время отвлечёмся и представим, что сами первичные данные: способ вычленения базового гаплотипа в выборке,
количество мутаций и их частота – достоверные, и общий предок всех представленных в выборке мужчин действительно жил 4130 лет назад.
Если обозначает скорость мутации, измеряемую, например, в количестве произошедших за год замен оснований на сайт, а обозначает время в годах, то
количество мутаций, которое произойдёт в течение этого времени, составляет базовых замен на сайт.
В клетках постоянно происходит огромное
количество мутаций.
Без молекулярных часов связь между
количеством мутаций вдоль рёбра и количеством времени может быть сложной для моделирования.
Здесь мы ещё раз повторимся так как это очень важно – что-бы вид не вымер а имел шансы выжить и совершенствоваться
количество мутаций на единицу вида и времени не должно быть очень большим для простых организмов и должно быть ещё меньше для более сложных.
Ведь что-бы вид не вымер а имел шансы выжить и совершенствоваться
количество мутаций на единицу вида и времени не должно быть очень большим для простых организмов и должно быть ещё меньше для более сложных.
Хотя это должно казаться очевидным и на самом деле верно, что нет возможности назначать основания внутренним вершинам таким способом, который потребует меньшего
количества мутаций, но не будем углубляться в строгое доказательство этого средствами комбинаторной теории графов.
Следовательно, иногда
количество мутаций скачком увеличивается.
Общий план таков: для данного дерева каким-то образом подсчитывается наименьшее
количество мутаций, которое потребовалось бы, если бы последовательности возникли от общего предка в соответствии с этим деревом.
Таким образом,
количество мутаций теперь равно 1, а вершина предка помечена, как показано на рисунке.
Чтобы оценить
количество мутаций никогда не вычисляются расстояния, а вместо этого рассматривается, как мутации происходят в имеющихся последовательностях на каждом отдельном участке.
В этом случае, независимо от топологии дерева, если поставим A в каждой внутренней вершине, то получим минимально возможное
количество мутаций.
Когда все вершины дерева помечены, конечное значение
количества мутаций даёт минимальное количество мутаций, необходимое для того, чтобы это дерево правильно описало эволюцию таксонов.